Nationalparken har en mycket varierad natur och täcker i stort sett två mycket olika områden. Längst i norr ligger parken vid den södra stranden av Chobe-floden, en stor biflod till Zambezi-floden på den lätt sluttande savannen med många stora träd längs vattnet. Floden utgör också gränsen mot Namibias Kaprivi-provins. I denna del av parken är elefanter överlägset de mest dominerande djuren under en safari, oavsett om den görs med bil eller på floden i en båt. Safari med båt är områdets specialitet.
Ungefär hälften av Botswanas imponerande bestånd på över 100 000 elefanter lever i Chobe, vilket tydligt syns på många träd som de sliter på i jakten på färska blad och bark. Tillsammans med närområdet utgör detta helt enkelt Afrikas största elefantbestånd och därmed även världens största. Det är generellt möjligt att komma mycket nära elefanterna både på land och från vattnet. Längs och i floden finns också massor av flodhästar samt stora hjordar av bufflar, ibland bestående av mer än 1 000 djur. Dessa är de lokala lejonens favoritbyte men jakten äger vanligtvis rum i den tätare vegetationen en liten bit bort från floden. Det finns också många andra stora växtätare, inklusive stor kudu, roanantilop, sabelantilop och impala.
Parkens södra delar består av sandiga områden runt Savute-kanalen som bara periodvis har vatten och Savute-sumpmarkerna som ofta torkar ut. Här är landskapet mer öppet och det finns inte lika många elefanter, dock ändå tillräckligt många för att några av de lokala lejonflockarna ska ha specialiserat sig på att fånga unga individer och isolera dem. I detta område är giraffer vanliga och under vissa perioder ses många zebror som här har vad man kallar skuggremsor i mitten av de vita ränderna. Leoparder, fläckiga hyenor och vildhundar finns över hela parken, medan geparder främst håller till på den platta savannen runt Savute. Särskilt runt Chobe-floden och de mest vattenrika delarna av Savute finns ett imponerande fågelliv med arter som lever i vatten och äter fisk, medan det på savannen framför allt finns många gamar och örnar. Staden Kasane vid gränsen till Chobe i nordöst eller Victoria Falls cirka 80 km åt öst utgör oftast porten till parken eller avslutningen på en safari därifrån.
Höjdpunkter:
Högsäsong: Juli till oktober